La maladie bipolaire s’accompagne d’une importante comorbidité, c'est-à-dire qu’elle est souvent associée à d’autres troubles. Cette association modifie souvent l’expression de la maladie et peut affecter son pronostic et la réponse au traitement. Il est donc primordial de dépister cette comorbidité et de la traiter conjointement au trouble bipolaire. Elle concerne essentiellement :
 la consommation d’alcool et de toxiques
 les troubles paniques
 le trouble obsessionnel compulsif ou TOC
 les troubles des conduites alimentaires
 les troubles de la personnalité
 le surpoids et l’obésité
 le diabète
 les maladies cardiovasculaires